综上所述,本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术,探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外,作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化,其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量,对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明,黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱,而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。天津蛋白组学定量
TMT标记定量蛋白质组学研究案例:2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学研究方法,发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征,探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷,AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴,为高风险三阴性乳腺*患者的下一代***方法提供了理论依据。中文标题:铜耗竭调节线粒体氧化磷酸化以损害三阴性乳腺*转移研究对象:高风险三阴性乳腺*(TNBC)发表期刊:NatureCommunications影响因子:14.919发表时间:2021年12月合作单位:纪念斯隆凯特琳**中心,Sandra和EdwardMeyer**中心运用关键生物技术:TMT标记定量蛋白质组学和靶向代谢组学吉林国内蛋白组学公司排名修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。
作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题:氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象:茶树根发表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子:5.279发表时间:2021年9月1日发表单位:安徽农业大学运用生物技术:TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢,通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。
本文为中国科学院海岸带研究所赵建民课题组在ScienceoftheTotalEnvironment期刊发表了的文章,通过iTRAQ标记定量蛋白质组学研究弧菌***加剧了海洋酸化造成的牡蛎免疫抑制效应。海洋酸化可能增加海洋软体动物疾病加剧的风险。从而将产生重大的经济和生态影响,因此本研究结果具有重要的指导意义。在本研究中,研究者将太平洋牡蛎暴露于酸化海水(约2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌进行***处理,以此研究海洋酸化是否会影响牡蛎对病原菌***的免疫反应。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白质组学方法,对牡蛎鳃这一潜在的造血部位进行了研究,以分析对OA和金氏弧菌共同作用较敏感的生理过程。蛋白质组学,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。
文章使用TMT标记定量蛋白质组学的方法,分析鉴定了差异表达的蛋白质,对下调的蛋白质进行基因本体论(GO)分析,显示下调参与线粒体电子传递链(ETC)的途径富集,证明了TM处理特别影响了具有较高细胞内铜水平的SOX2/OCT4+细胞中的线粒体ETC途径。确定TM介导的铜依赖性线粒体复合物IV失活是SOX2/OCT4+群体中的主要代谢缺陷。研究结果确定了铜-代谢-转移轴,并强调了其作为高危TNBC患者的下一代***方法的潜力。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶,是线粒体ETC的终末酶。蛋白组学技术对肾错构瘤尿液差异蛋白的研究。天津蛋白组学定量
蛋白组+代谢组+脂质组-数据分析系统。天津蛋白组学定量
蛋白质组学研究方法研究案例:2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。天津蛋白组学定量
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